В МФТИ рассчитали распространённость редкой формы нарушения зрения
МФТИ — Московский физико-технический институт ·
Исследователи Московского физико-технического института совместно с коллегами из российских научных и медицинских центров выяснили, что KCNV2-ассоциированная ретинопатия – наследственная болезнь, приводящая к нарушению зрения, – встречается в десятки раз чаще, чем считалось на основании клинических данных. Учёные провели оценку распространенности редких генетических заболеваний, результаты опубликованы в международном научном журнале International Journal of Molecular Sciences. KCNV2-ассоциированная ретинопатия – это редкое наследственное заболевание глаз, приводящее к поражению сетчатки и ухудшению зрения. Как правило, болезнь начинается в детском возрасте и проявляется снижением остроты зрения, также может наблюдаться светобоязнь, нарушение цветового зрения, нистагм (непроизвольные движения глаз). Заболевание передаётся по аутосомно-рецессивному типу, то есть проявляется только при наличии двух пораженных копий гена – по одной от каждого родителя-носителя. Согласно клиническим данным, распространённость заболевания оценивалась как 1 случай на 865 тысяч человек. Однако анализ генетических данных показал, что даже при самых консервативных оценках болезнь встречается с частотой 1 на 343 тысячи, а с учётом потенциально патогенных вариантов – до 1 на 14 тысяч, что в десятки раз превышает предыдущие клинические данные. Для того, чтобы выяснить это, мы использовали данные крупнейшей глобальной базы gnomAD, которая включает 807 тысяч человек, и российских геномных баз GDB и EvogenDB (144 тысячи человек). Применили байесовский подход и многоуровневую систему оценки патогенности генетических вариантов. Это позволило учесть варианты неопределённого клинического значения (выявить среди них потенциально патогенные генетические варианты) и получить не одну цифру, а реалистичный диапазон. При этом даже наиболее консервативные оценки демонстрируют более высокую распространённость, чем считалось ранее» отметила первый автор научной работы, исследователь лаборатории мультиомики МФТИ Анастасия Рожкова. Данную болезнь может быть трудно диагностировать из-за клинической вариабельности, в связи с чем не все пациенты получают молекулярное подтверждение. По словам авторов, новый подход – это сигнал врачам: пациентов с этой патологией может быть значительно больше, чем регистрируется сейчас. Кроме того, исследователи проанализировали данные 15 российских пациентов с подтверждённым диагнозом. Было обнаружено 5 генетических вариантов, не описанных ранее в литературе. Наша работа демонстрирует, что в данном гене предстоит открыть ещё много патогенных вариантов, важную роль в этом может сыграть использование не только глобальных, но и отечественных генетических ресурсов» добавила Анастасия Рожкова. Уточнение статистических данных важно не только для понимания масштаба проблемы. Это помогает планировать клинические испытания и разработку генотерапевтических препаратов, а также настраивать диагностические алгоритмы с учётом популяционных особенностей.
Исследователи Московского физико-технического института совместно с коллегами из российских научных и медицинских центров выяснили, что KCNV2-ассоциированная ретинопатия – наследственная болезнь, приводящая к нарушению зрения, – встречается в десятки раз чаще, чем считалось на основании клинических данных. Учёные провели оценку распространенности редких генетических заболеваний, результаты опубликованы в международном научном журнале International Journal of Molecular Sciences. KCNV2-ассоциированная ретинопатия – это редкое наследственное заболевание глаз, приводящее к поражению сетчатки и ухудшению зрения. Как правило, болезнь начинается в детском возрасте и проявляется снижением остроты зрения, также может наблюдаться светобоязнь, нарушение цветового зрения, нистагм (непроизвольные движения глаз). Заболевание передаётся по аутосомно-рецессивному типу, то есть проявляется только при наличии двух пораженных копий гена – по одной от каждого родителя-носителя. Согласно клиническим данным, распространённость заболевания оценивалась как 1 случай на 865 тысяч человек. Однако анализ генетических данных показал, что даже при самых консервативных оценках болезнь встречается с частотой 1 на 343 тысячи, а с учётом потенциально патогенных вариантов – до 1 на 14 тысяч, что в десятки раз превышает предыдущие клинические данные. Для того, чтобы выяснить это, мы использовали данные крупнейшей глобальной базы gnomAD, которая включает 807 тысяч человек, и российских геномных баз GDB и EvogenDB (144 тысячи человек). Применили байесовский подход и многоуровневую систему оценки патогенности генетических вариантов. Это позволило учесть варианты неопределённого клинического значения (выявить среди них потенциально патогенные генетические варианты) и получить не одну цифру, а реалистичный диапазон. При этом даже наиболее консервативные оценки демонстрируют более высокую распространённость, чем считалось ранее» отметила первый автор научной работы, исследователь лаборатории мультиомики МФТИ Анастасия Рожкова. Данную болезнь может быть трудно диагностировать из-за клинической вариабельности, в связи с чем не все пациенты получают молекулярное подтверждение. По словам авторов, новый подход – это сигнал врачам: пациентов с этой патологией может быть значительно больше, чем регистрируется сейчас. Кроме того, исследователи проанализировали данные 15 российских пациентов с подтверждённым диагнозом. Было обнаружено 5 генетических вариантов, не описанных ранее в литературе. Наша работа демонстрирует, что в данном гене предстоит открыть ещё много патогенных вариантов, важную роль в этом может сыграть использование не только глобальных, но и отечественных генетических ресурсов» добавила Анастасия Рожкова. Уточнение статистических данных важно не только для понимания масштаба проблемы. Это помогает планировать клинические испытания и разработку генотерапевтических препаратов, а также настраивать диагностические алгоритмы с учётом популяционных особенностей.